Новости города БезФормата.Ru
Санкт-Петербург
Главные новости
 
Задать вопрос?

Летняя школа по биоинформатике собрала начинающих исследователей в области генетики, медицины, информатики

Летняя школа по биоинформатике собрала начинающих исследователей в области генетики, медицины, информатики - НИУ ИТМО
Летняя школа по биоинформатике-2016 - НИУ ИТМО
Летняя школа по биоинформатике-2016 - НИУ ИТМО
Летняя школа по биоинформатике-2016. Источник: социальные сети - НИУ ИТМО
Фото: www.ifmo.ru
В конце июля в Петербурге состоялась четвертая Летняя школа по биоинформатике для студентов и молодых ученых. На событие съехались 100 участников из университетов по всей России. В течение пяти дней они работали над научными проектами, выступали на конференции с докладами, слушали лекции российских и зарубежных ученых-профессионалов. В этом году программа школы была сосредоточена на крайне актуальной теме – медицинской биоинформатике.

Школа была организована Институтом биоинформатики и Санкт-Петербургским Академическим университетом РАН. Сегодня технологии секвенирования развиваются и становятся все более доступными для применения в медицине, в частности, для ранней диагностики наследственных заболеваний и разработки лекарственных препаратов. Однако специалистов, способных обрабатывать и грамотно интерпретировать данные секвенирования, не хватает. Таким образом, с помощью Летней школы студенты могут узнать о последних новостях в области биоинформатики, познакомиться с методиками исследовательской работы в этой сфере, получить начальные навыки по решению практических задач в медицине и биологии.

Мероприятие стало самым масштабным в России в этой области. В нем приняли участие молодые ученые не только из РФ, но и из стран ближнего зарубежья. Более 20 человек получили гранты на обучение в Летней школе от спонсоров, в том числе студенты Университета ИТМО. 

Программа летней школы была рассчитана на людей, которые недавно стали заниматься биоинформатикой. Те, кто вообще ничего не знал в этой области до поездки на школу, могли заранее получить базовые знания по биологии и генетике с помощью специального онлайн-курса. Программа была разделена на две части в соответствии с компетенциями участников: один поток студентов занимался математикой и информатикой, другой – биологией и медициной. Группа медиков и биологов изучала программирование, статистику и методы анализа данных секвенирования, а группа математиков и информатиков изучала молекулярную биологию и генетику, а также методики применение машинного обучения в биоинформатике. Занятия проводились параллельно для двух групп участников в течение всей школы.

Молодые ученые, которые хотели полностью погрузиться в научную работу, смогли принять участие в разработке реальных проектов, которые были рассчитаны на разный уровень подготовки исследователей. Например, участники школы разрабатывали алгоритмы оценки соотношения раковых клеток к здоровым по сканам человеческой грудной ткани. Исследователи должны были выбрать лучшую методику для автоматического определения количества раковых клеток. В рамках другой научной работы начинающие ученые могли получить знания по методикам секвенирования генома, а том числе тех, которые подразумевают «расшифровку» только тех участков ДНК, которые кодируют белки. Именно в этой части генома мутации могут иметь самые тяжелые последствия для здоровья человека. Также участники школы узнали о методиках машинного обучения для определения аутоиммунных антител, которые приводят к одноименным заболеваниям. Эти заболевания, в свою очередь, сегодня связывают с возникновением болезни Альцгеймера. Анализ антител в сыворотке крови является перспективной диагностикой болезни. Разработчики этого проекта стали победителями конкурса в рамках Летней школы. Также участники занимались научной работой и по другим научным тематикам. Руководителями разработок выступали ведущие мировые ученые.

В качестве лекторов на школу были приглашены ученые из разных областей биоинформатики, медицины и биологии. Например, Елена Григоренко (Baylor College of Medicine, Yale University, University of Houston) рассказала об использовании разных типов полногеномного секвенирования для изучения типичных (нейротипичных) и нетипичных (нейронетипичных) траекторий развития. Андрей Афанасьев (CEO iBinom, сотрудник лаборатории функционального анализа генома МФТИ) выступил на летней школе сразу с несколькими лекциями о современном состоянии биоинформатического рынка и направлениях его развития, о биоинформатике в медицине. Дмитрий Фишман   (University of Tartu, Estonia) прочитал лекцию о работе мозга, о том, как обрабатываются различные сигналы от внешнего мира и как происходит принятие решений на основании полученной информации, об эволюции методов машинного обучения в изучении мозга и о применении Deep Learning в биоинформатике. Также на школе выступили Алла Лапидус (научный советник Института биоинформатики), Константин Оконечников (German Cancer Research Center), Александр Предеус (Институт биоинформатики) и другие ученые.

Также для участников школы прошла однодневная научная конференция. Студенты, аспиранты, сотрудники компаний выступили с докладами о молекулярном атласе человека, о возможностях компьютерного моделирования на основе нейронной сети, проанализировали влияние генетических факторов и курения на риск развития инфаркта миокарда с возрастом и многое другое.

В 2016 году школу поддержали компании JetBrains, BIOCAD, EPAM и Parseq Lab – резидент Технопарка Университета ИТМО. Четвертый год подряд мероприятие поддерживает «Российская венчурная компания», которая, в том числе, развивает проекты в области геномики и системной биологии. Университет ИТМО совместно с Институтом биоинформатики организует выездные семинары по системной биологии.

Наталья Блинникова ,

Редакция новостного портала Университета ИТМО

Комар. Фото Getty - Metro ПетербургВиктор Олейник Исследователи провели эксперимент с участием мышей Укусы комаров вызывают в организме человека целый ряд необычных иммунных реакций, выяснила группа учёных из Бэйлорского колледжа медицины (США).
20.05.2018 Metro Петербург
Молодежная яхтенная регата MAKAROV SAILING CUP впечатляющий праздник в акватории Финского залива! - ГМА им. адм. С.О.МакароваПобеда всех и каждого! Молодежная яхтенная регата «MAKAROV SAILING CUP»: впечатляющий праздник в акватории Финского залива!
20.05.2018 ГМА им. адм. С.О.Макарова
19 мая в ДК «Выборгский» депутат Законодательного Собрания Санкт-Петербурга Галина Назарова торжественно открыла праздничный гала-концерт «Нарисуй этот МИР»,
20.05.2018 Единая Россия
В Санкт-Петербурге прошла тренировочная эвакуация из здания крупнейшего исследовательского центра России по разработке и созданию робототехнических комплексов - ГУ МЧС России по СПб17 мая в Санкт-Петербурге прошла тренировочная эвакуация из здания крупнейшего исследовательского центра России по разработке и созданию робототехнических комплексов космического, воздушного,
20.05.2018 ГУ МЧС России по СПб
1 - Военный институт войск национальной гвардии РФ15 и 16 мая 2018 года в Санкт — Петербургском военном институте войск национальной гвардии были проведены военно-спортивные игры «Зарничка» среди детей дошкольных учреждений и «Зарница» среди учащихся школ допризывного в
20.05.2018 Военный институт войск национальной гвардии РФ
Делегация из Вьетнама в СПбГУТ - СПбГУТ  им.проф. М.А. Бонч-Бруевича17-19 мая в Санкт-Петербурге проходит Российско-вьетнамский культурно-деловой форум.
20.05.2018 СПбГУТ им.проф. М.А. Бонч-Бруевича
Школьная городская юбилейная конференция, посвященная 315-летию Санкт-Петербурга и Балтийского Флота - ГМА им. адм. С.О.МакароваШкольная городская юбилейная конференция, посвященная 315-летию Санкт-Петербурга и Балтийского Флота 15 мая 2018 года в Юношеском читальном зале Российской национальной библиотеки прошла историческая школьная городска
19.05.2018 ГМА им. адм. С.О.Макарова
Делегация из Вьетнама в СПбГУТ - СПбГУТ  им.проф. М.А. Бонч-Бруевича17-19 мая в Санкт-Петербурге проходит Российско-вьетнамский культурно-деловой форум.
20.05.2018 СПбГУТ им.проф. М.А. Бонч-Бруевича
Молодежная яхтенная регата MAKAROV SAILING CUP впечатляющий праздник в акватории Финского залива! - ГМА им. адм. С.О.МакароваПобеда всех и каждого! Молодежная яхтенная регата «MAKAROV SAILING CUP»: впечатляющий праздник в акватории Финского залива!
20.05.2018 ГМА им. адм. С.О.Макарова
1 - Военный институт войск национальной гвардии РФ15 и 16 мая 2018 года в Санкт — Петербургском военном институте войск национальной гвардии были проведены военно-спортивные игры «Зарничка» среди детей дошкольных учреждений и «Зарница» среди учащихся школ допризывного в
20.05.2018 Военный институт войск национальной гвардии РФ
Комар. Фото Getty - Metro Петербург
Учёные выяснили, как комариные укусы влияют на иммунитет
Виктор Олейник Исследователи провели эксперимент с участием мышей Укусы комаров вызывают в организме человека целый ряд необычных иммунных реакций, выяснила группа учёных из Бэйлорского колледжа медицины (США).
Metro Петербург
Марс: миссия выполнима. Как россияне изучают Красную планету | Пока самолично мы до Марса не добрались, программистские компании предлагают побывать там с помощью очков виртуальной реальности. Попривыкнуть. ФОТО Ferrari/ZUMA PRESS/ТАСС - Санкт-Петербургские ведомости
Марс: миссия выполнима. Как россияне изучают Красную планету
Пока самолично мы до Марса не добрались, программистские компании предлагают побывать там с помощью очков виртуальной реальности.
Санкт-Петербургские ведомости
Полный бак: исследуем качество бензина в Петербурге | Заправочный пистолет, как «русская рулетка». Одно нажатие, и что будет дальше - никто не знает. ФОТО Александра РЮМИНА/ТАСС - Санкт-Петербургские ведомости
Полный бак: исследуем качество бензина в Петербурге
Заправочный пистолет, как «русская рулетка». Одно нажатие, и что будет дальше - никто не знает.
Санкт-Петербургские ведомости
В Ленобласти разбился спортивный самолет Су-29, пилот погиб на месте - Санкт-Петербург.руУ предпринимателя Владимира Чвокова осталась жена и двое сыновей. В Ломоносовском районе Ленинградской области разбился спортивный самолет Су- 29.
20.05.2018 Санкт-Петербург.ру
Сейчас медики проверяют не только физическое здоровье потерпевшего, но и психическое.
20.05.2018 ИА Невские Новости
Девушка уехала, а молодому человеку пришлось общаться с сотрудниками полиции.
20.05.2018 ИА Невские Новости
В Ленобласти при жесткой посадке двухместного Су-29 погиб человек. Фото Все - скриншот YouTube - Metro Петербург
Смертельная посадка СУ-29 в Ленобласти: в Сети появилось видео
Сидоровская Наталья При жесткой посадке самолет загорелся В Ленобласти на месте крушения двухместного спортивно-пилотажного самолета Су-29 работают следователи и криминалисты.
Metro Петербург
Человек сгорел при пожаре в Ленобласти - Мой район
Человек сгорел при пожаре в Ленобласти
В садоводстве под СИверским тушили пожар в частном доме. Как сообщают в МЧС по Ленобласти, в ночь на 20 мая в садоводстве «Зеленая гора» горел дачный дом.
Мой район
rheitybt - Мой район
Пилот погиб при крушении самолета в Ленобласти
В Ломоносовском районе Ленинградской области рухнул двухместный самолет. Фото: Vzletim.aero Инцидент произошел днем в воскресенье, 20 мая, на аэродроме Куммолово, сообщают в авиации.
Мой район
В Петербурге прошла "Ночь музеев - 2018". Фото все - Святослав Акимов., "Metro" - Metro ПетербургСидоровская Наталья В городе состоялась "Ночь музеев - 2018" В России прошла ежегодная акция "Ночь музеев".
20.05.2018 Metro Петербург
«Золотую пальмовую ветвь» отдали японским «Магазинным воришкам» любимца фестивалей Хирокадзу Корээды Фото: REUTERS - Комсомольская правдаПриз за лучшую женскую роль ушел российской картине "Айка" Стас ТЫРКИН Фестиваль выдался кризисный, прошел практически без звезд, при почти полном игноре со стороны Голливуда (показ единственного блокбастера,
19.05.2018 Комсомольская правда
Ночь музеев в Петербурге: новичок – звучит гордо - Санкт-Петербург.руГород контрастов, 128 мужских писсуаров на стадионе Кирова, таинственная зеленой стенка, ироничные ученые и многое другое – в материале «Санкт-Петербург.ру».
20.05.2018 Санкт-Петербург.ру
На работу - на велосипеде. Фото все - Святослав Акимов., "Metro" - Metro Петербург
Петербуржцы добирались на работу и учебу на велосипеде
Сидоровская Наталья В городе прошла акция в 12-ый раз В Петербурге рабочая неделя завершилась традиционной акцией "На работу на велосипеде".
Metro Петербург
Как Хан Соло нашел своего Чубаку | Изображение: wdsspr.ru - Санкт-Петербургские ведомости
Как Хан Соло нашел своего Чубаку
Изображение: wdsspr.ru 24 мая состоится премьера нового фильма «звездной эпопеи» «Хан Соло: Звездные войны.
Санкт-Петербургские ведомости
Презентация книги «Наследие. Избранное. Том I» | Фото: Эжена Быкова - Санкт-Петербургские ведомости
Презентация книги «Наследие. Избранное. Том I»
Фото: Эжена Быкова «Санкт-Петербургские ведомости» издали новый исторический бестселлер.
Санкт-Петербургские ведомости
Парни на футбольной коробке. Фото Василий Кузьмичёнок - Metro ПетербургКирилл Сосков Репортаж Metro До чемпионата мира по футболу в России - считанные дни.
20.05.2018 Metro Петербург
Книгу сказок от Роналду представили в Петербурге - Мой районНа Международном книжном салоне представили книгу сказок от Роналду и других футболистов Португалии.
20.05.2018 Мой район
Малышка Есеня ФОТО: Инстаграм - Комсомольская правдаГодовалая Есеня очень похожа на папу Екатерина СЕМЕНОВА В феврале 2017 года у Андрея Аршавина родился четвертый ребенок.
20.05.2018 Комсомольская правда
Робот-вратарь обыграл аргентинского футболиста - Мой район
Робот-вратарь обыграл аргентинского футболиста
Бывший нападающий сборной Аргентины Эрнан Креспо приехал в Петербург и сразился с «робокипером».
Мой район
Стадион «Санкт-Петербург» назвали лучшей ареной - Мой район
Стадион «Санкт-Петербург» назвали лучшей ареной
Аркадий Дворкович, глава оргкомитета по подготовке к ЧМ-2018, дал оценку стадиону «Санкт-Петербург».
Мой район
Возбуждено уголовное дело по факту аварии Су-29 в Ленинградской области, в результате которой погиб один человек - Северо-Западное следственное управление на транспортеЛенинградским следственным отделом на транспорте Северо-Западного следственного управления на транспорте СКР по факту аварии Су-29 в Ломоносовском районе Ленинградской области,
20.05.2018 Северо-Западное следственное управление на транспорте
​Северо-Западной транспортной прокуратурой организована проверка в связи с происшествием в Пулково - СЗТПСеверо-Западной транспортной прокуратурой организована проверка исполнения законодательства о безопасности полетов в связи с происшествием 20.05.2018 около 13.
20.05.2018 СЗТП
Торжественная церемония прошла рядом с Могилой Неизвестного Солдата. Фото Василий Кузьмичёнок, "Metro" - Metro ПетербургМария Беленькая Преображенцы поцеловали боевое знамя своего полка Репортёры Metro посмотрели, как в Александровском саду провожают на дембель срочников одного из самых престижных полков в России.
20.05.2018 Metro Петербург
Церковь Архангела Михаила в центре Грозного, в которой четверо боевиков пытались захватить прихожан в качестве заложников. Фото РИА Новости - Metro ПетербургВиктор Олейник Бандитов ликвидировали при спецоперации Террористическая группировка "Исламское государство" (запрещена в РФ) взяла на себя ответственность за нападение на церковь в Грозном.
20.05.2018 Metro Петербург
Илон Маск. Фото AFP - Metro ПетербургВиктор Олейник Полноприводная Tesla Model 3 будет стоить 78 тысяч долларов Глава Tesla Motors Илон Маск рассказал в своём Twitter подробности о новой модификации электромобиля Model 3, которую скоро выпустит компания.
20.05.2018 Metro Петербург